Projekty programu OP JAK kladou zvýšené nároky na otevřené publikování. Otevřená data je třeba zveřejnit v otevřeném repozitáři a měl by jím být přidělen perzistentní identifikátor. Publikace samotná by měla být publikována na úrovni gold open access a zároveň bezprostředně po publikaci v časopise by měla být umístěna také do institucionálního repozitáře. Publikace by měla obsahovat odkaz na otevřená data.
